El órgano de la Iglesia de Los Venerables es obra del reconocido organero Gerhard Grenzing, que supo adaptar la estética del nuevo instrumento a la rica decoración del templo de los Venerables, que cuenta con obras de la talla de Murillo, Lucas Valdés y Pedro Roldán.
El órgano fue inaugurado el 5 de noviembre de 1991 con un concierto que presidió la Reina Doña Sofía y en el que José Enrique Ayarra, organista titular en aquel entonces, interpretó obras de Bach y de los compositores españoles: Antonio de Cabezón y Manuel Castillo.
Con el paso de los años este instrumento se ha convertido en el eje de la programación musical de la Fundación Focus Loyola. La cuidada y esmerada selección de las obras así como de los participantes ha convertido esta actividad musical en un referente el ámbito de la música de órgano.
